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    miRNA實(shí)驗(yàn)解決方案(操作手冊(cè))---第三章:miRNA 逆轉(zhuǎn)錄及實(shí)時(shí)熒光定量 PCR

    發(fā)布時(shí)間: 2025-01-08  點(diǎn)擊次數(shù): 36次

    一、miRNA 逆轉(zhuǎn)錄及實(shí)時(shí)熒光定量 PCR的概念
    miRNA逆轉(zhuǎn)錄的概念

    成熟miRNA的長(zhǎng)度只有21~23nt,對(duì)miRNA進(jìn)行qPCR定量時(shí),無法直接對(duì)其進(jìn)行正、反向引物的設(shè)計(jì)(通常正向引物就足以覆蓋miRNA全長(zhǎng)),但是可以通過增加逆轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物長(zhǎng)度來解決這一問題,miRNA的逆轉(zhuǎn)錄方法有兩種,分別是莖環(huán)法和加尾法。

    實(shí)時(shí)熒光定量PCR的概念
    實(shí)時(shí)熒光定量PCR即Real-time PCR,利用熒光信號(hào)積累實(shí)時(shí)監(jiān)測(cè)整個(gè)PCR進(jìn)程,最后通過Cr值和標(biāo)準(zhǔn)曲線對(duì)未知模版進(jìn)行定量分析的方法。


    二、miRNA逆轉(zhuǎn)錄及實(shí)時(shí)熒光定量PCR的原理

    莖環(huán)法原理

    莖環(huán)法miRNA逆轉(zhuǎn)錄最關(guān)鍵的一步就是設(shè)計(jì)莖環(huán)逆轉(zhuǎn)錄引物(由莖環(huán)結(jié)構(gòu)和miRNA3'末端六個(gè)反向互補(bǔ)的堿基組成),莖環(huán)逆轉(zhuǎn)錄引物首先與miRNA3'末端結(jié)合,在逆轉(zhuǎn)錄酶的作用下進(jìn)行反應(yīng),獲得人為加長(zhǎng)的miRNA第一鏈cDNA。針對(duì)不同的miRNA,需要設(shè)計(jì)不同的莖環(huán)逆轉(zhuǎn)錄引物、配制不同的逆轉(zhuǎn)錄體系,因此莖環(huán)法miRNA逆轉(zhuǎn)錄具有特別高的特異性。

    注:莖環(huán)逆轉(zhuǎn)錄引物中的莖環(huán)結(jié)構(gòu)為固定已知序列,只需按照不同的miRNA序列3'末端的六個(gè)堿基,將其反向互補(bǔ)添加至莖環(huán)結(jié)構(gòu)序列的3'端即可設(shè)計(jì)出特異性的莖環(huán)逆轉(zhuǎn)錄引物。

    加尾法原理

    增加miRNA逆轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物長(zhǎng)度最直接的方法就是增加miRNA的長(zhǎng)度,加尾法首先通過PolyA)聚合酶(PAP)向miRNA3'末端添加PolyA)尾,然后在逆轉(zhuǎn)錄酶的作用下,結(jié)合逆轉(zhuǎn)錄引物(由3'端帶有錨定堿基的Oligo dT序列和一段通用序列組成),即可獲得加長(zhǎng)版的cDNA。加尾法逆轉(zhuǎn)錄可以對(duì)提取純化的所有miRNA進(jìn)行無差別加尾,能夠同時(shí)逆轉(zhuǎn)樣本中多個(gè)miRNA,一次逆轉(zhuǎn)錄即可完成對(duì)所有qPCR模板的制備。

    注:錨定堿基NVV代表A、GC,N代表ATGC中的任意一種)能夠特異性的結(jié)合到PolyA)的5'端,以免逆轉(zhuǎn)出更多的T堿基,保證同一miRNA的逆轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物大小相同;在Oligo dT序列的5'端存在一段可用于qPCR檢測(cè)的反向通用引物與cDNA的結(jié)合。


    2、熒光定量PCR的化學(xué)原理

    變產(chǎn)物DNA分子為熒光信號(hào),通過測(cè)定熒光值即可反映產(chǎn)物DNA分子量,實(shí)時(shí)熒光定量PCR的化學(xué)方法有兩種,分別是SYBR®Green染料法和 TaqMan®Probe探針法。

    SYBR®Green 染料法原理

    一種DNA小溝非飽和性結(jié)合染料,與DNA結(jié)合時(shí)發(fā)光,不結(jié)合(游離)時(shí)不發(fā)光,每形成一條DNA雙鏈,就會(huì)有一定數(shù)量的染料結(jié)合上去,染料一結(jié)合,就會(huì)產(chǎn)生熒光信號(hào),信號(hào)強(qiáng)度與DNA分子總數(shù)目成正比。

    TaqMan®Probe探針法原理

    一種水解探針(5'Reporter3'Quencher),完整時(shí)不發(fā)光,水解后發(fā)光,每形成一條DNA鏈,就會(huì)水解一條探針,每水解一條探針,就會(huì)產(chǎn)生一個(gè)單位信號(hào),信號(hào)強(qiáng)度與結(jié)合過探針的DNA分子總數(shù)目成正比。

    注:探針要先于引物結(jié)合在模板上,因此Tm(探針)要比Tm(引物)大810℃。

    SYBR®Green 染料法 VS TaqMan®Probe探針法原理

    SYBR®Green 染料法:表達(dá)量比較高時(shí)推薦使用;

    TaqMan®Probe 探針法原理:表達(dá)量比較低時(shí)推薦使用;


    三、miRNA逆轉(zhuǎn)錄及實(shí)時(shí)熒光定量PCR的操作流程
    1.莖環(huán)法miRNA逆轉(zhuǎn)錄反應(yīng)
    Vazyme 莖環(huán)法 miRNA cDNA 一鏈合成的專用試劑盒 ----------miRNA 1st Stand cDNA Synthesis kit(by stem-loop)(Vazyme #MR101)

    Vazyme #MR101 產(chǎn)品優(yōu)勢(shì)

    1.優(yōu)秀的線性關(guān)系:在寬廣的模版區(qū)間內(nèi)具有良好的線性關(guān)系,可檢出低至pg級(jí)RNA模版。

    2.優(yōu)秀的反應(yīng)體系:最適的Buffer組分及濃度,更適用于miRNA的逆轉(zhuǎn)錄。

    3.簡(jiǎn)便的引物設(shè)計(jì):提供配套的引物設(shè)計(jì)軟件,使得引物設(shè)計(jì)更加簡(jiǎn)便。

    Vazyme #MR101實(shí)驗(yàn)案例-----優(yōu)秀的線性關(guān)系

    以小鼠肝臟組織Total RNA10倍稀釋梯度(10pg1μg)為模板,使用miRNA 1st StrandcDNA Synthesis Kit by stem-loop) (Vazyme MR101)進(jìn)行逆轉(zhuǎn)錄,得到的cDNA使用miRNA Universal SYBR qPCR Master MixVazyme MQ101)擴(kuò)增mmu-miR-16基因。結(jié)果顯示, 在寬廣的模板區(qū)間內(nèi),該配套產(chǎn)品具有優(yōu)異的線性關(guān)系。

    ·注意事項(xiàng)

    1.防止RNase污染:保持實(shí)驗(yàn)區(qū)域潔凈;操作時(shí)需穿戴干凈的手套、口罩;實(shí)驗(yàn)所用的離心管、槍頭等耗材均需保證RNase-free

    2.5xgDNA Wiper Mix的使用:5xgDNA Wiper Mix含有高濃度的甘油,使用前請(qǐng)短暫離心收集到反應(yīng)管底部,并用移液器輕輕吹打混勻。不應(yīng)使槍頭插入液面過深,否則會(huì)因槍頭壁的粘附造成酶量的損失。

    3.反應(yīng)液的配制請(qǐng)?jiān)诒喜僮魍瓿伞?/span>

    ·實(shí)驗(yàn)流程

    1.基因組DNA去除

    a.RNase-free 離心管中配制如下混合液:

    用移液器輕輕吹打混勻。

    b.按下列條件進(jìn)行基因組DNA去除反應(yīng):42°C 2min。

    2.第一鏈cDNA合成

    a.在RNase-free離心管中配制如下混合液:

    莖環(huán)引物推薦使用本公司miRNA Design軟件進(jìn)行設(shè)計(jì),此時(shí),cDNA產(chǎn)物后續(xù)定量產(chǎn)品--miRNAUniversal SYBR qPCR Master MixVazyme MQ101)中配套的逆向qPCR引物可直接使用,無需另外設(shè)計(jì)合成。
    用移液器輕輕吹打混勻。

    b.按下列條件進(jìn)行第一鏈cDNA合成反應(yīng):

    如果模版具有復(fù)雜二級(jí)結(jié)構(gòu)或高GC區(qū)域,可將反應(yīng)溫度提高至55°C,有助于提高產(chǎn)量。
    產(chǎn)物可立即用于qPCR反應(yīng),短期保存建議存放-20°C;長(zhǎng)期保存建議存放-70°C;cDNA應(yīng)避免反復(fù)凍融。

    2、加尾法miRNA逆轉(zhuǎn)錄反應(yīng)

    Vazyme 加尾法 miRNA逆轉(zhuǎn)錄是無法使用普通的逆轉(zhuǎn)錄試劑盒進(jìn)行逆轉(zhuǎn)錄的,因?yàn)槠淙鄙?/span>PolyA)聚合酶,無法添加PolyA)尾。Vazyme為您提供加尾法miRNA合成cDNA的專用試劑盒-miRNA 1st Strand cDNA Synthesis Kitby tailing A)(Vazyme MR201)。

    ·Vazyme MR201 產(chǎn)品優(yōu)勢(shì)

    1特別優(yōu)秀的逆轉(zhuǎn)錄性能:逆轉(zhuǎn)錄效率高且熔解曲線單峰。

    2.超高的逆轉(zhuǎn)錄特異性:專為miRNA逆轉(zhuǎn)錄定向改造的逆轉(zhuǎn)錄酶,搭配優(yōu)化的緩沖體系,在保證高靈敏度的同時(shí),最大限度降低 miRNA前體的逆轉(zhuǎn)錄。

    3.簡(jiǎn)便快捷的操作:加尾反應(yīng)與逆轉(zhuǎn)錄反應(yīng)一管進(jìn)行,使得操作更加方便。

    ·Vazyme MR201 實(shí)驗(yàn)案例一一超高的逆轉(zhuǎn)錄特異性

    HeLa miRNA為模板(100ngμl),分別使用專為miRNA逆轉(zhuǎn)錄定向改造的逆轉(zhuǎn)錄酶(VazymeMR201)和未定向改造的逆轉(zhuǎn)錄酶(其余組分與Vazyme MR201一致)進(jìn)行逆轉(zhuǎn)錄反應(yīng),在相同條件下對(duì)逆轉(zhuǎn)錄反應(yīng)得到的cDNA進(jìn)行qPCR檢測(cè)2個(gè)體系??梢钥吹剑褂?/span>Vazyme MR201逆轉(zhuǎn)錄 miRNAqPCR檢測(cè)得到的熔解曲線單峰且峰形優(yōu)異,特異性更高。


    注意事項(xiàng)
    1.防止RNase污染:保持實(shí)驗(yàn)區(qū)域潔凈;操作時(shí)需穿戴干凈的手套、口罩;實(shí)驗(yàn)所用的離心管、槍頭等耗材均需保證RNase-free。

    2.反應(yīng)液的配制請(qǐng)?jiān)诒喜僮魍瓿伞?/span>

    實(shí)驗(yàn)流程

    1.在RNase-free離心管中配制如下混合液:

    反應(yīng)中使用的Total RNA必須含有miRNA。
    用移液器輕輕吹打混勻。

    2.按下列條件進(jìn)行第一鏈cDNA合成反應(yīng):

    反應(yīng)得到的cDNA可立即或稀釋后用于熒光定量,對(duì)于高豐度表達(dá)的miRNA,可根據(jù)具體的Cr值,稀釋10~1000倍。
    cDNA應(yīng)避免反復(fù)凍融,短期保存建議存放-20°C;長(zhǎng)期保存建議存放-70°C。

    3、莖環(huán)法/加尾法miRNA實(shí)時(shí)熒光定量PCR

    Vazyme 提供 SYBR Green I嵌合熒光法進(jìn)行miRNA定量反應(yīng)的專用預(yù)混液-miRNA Unimodal SYBR qPCR Master MixVazyme MQ102),可同時(shí)兼容莖環(huán)和加尾逆轉(zhuǎn)產(chǎn)物。

    Vazyme MQ102 產(chǎn)品優(yōu)勢(shì)

    1.高效實(shí)驗(yàn):附贈(zèng)U6內(nèi)參上下游引物,配備莖環(huán)通用下游引物及相關(guān)設(shè)計(jì)軟件。

    2.高靈敏度:可在pg級(jí)的總RNA中檢測(cè)目的miRNA

    3.強(qiáng)特異性:區(qū)分單堿基的差異,非特異識(shí)別率低于5%。

    Vazyme #MQ102 實(shí)驗(yàn)案例--高效實(shí)驗(yàn)

    Vazyme #MQ102配備了miRNA 莖環(huán)引物設(shè)計(jì)軟件和配套下游通用莖環(huán)引物,同時(shí)附贈(zèng)人、大鼠、小鼠通用的U6內(nèi)參上下游引物,可在寬廣的定量范圍內(nèi)得到良好的標(biāo)準(zhǔn)曲線。


    Vazyme #MQ102 實(shí)驗(yàn)案例--高靈敏度:

    以293T細(xì)胞RNA為模版稀釋6個(gè)梯度(1pg-100ng),用miRNA 1st Stand cDNA Synthesis Kit(by stem-loop)(Vazyme #MR101)進(jìn)行反轉(zhuǎn)錄,獲得的cDNA用Vazyme

    MQ102 檢測(cè)hsa-miR-21-5p基因表達(dá)情況。結(jié)果顯示,Vazyme MQ102可在pg級(jí)的總RNA中檢測(cè)目的miRNA,且能在寬廣的定量范圍內(nèi)得到良好的標(biāo)準(zhǔn)曲線。




    Vazyme #MQ102 實(shí)驗(yàn)案例--強(qiáng)特異性:

    miRNA序列短,同一家族不同成員序列非常相似,有些僅有單個(gè)堿基差別,因此特異性對(duì)miRNA定量至關(guān)重要。Vazyme MQ102核心酶以雙抗封閉,配以優(yōu)化的Buffer,能夠區(qū)分單堿基的差異,非特異識(shí)別率低于5%,實(shí)現(xiàn)高特異性定量。

    莖環(huán)定量引物設(shè)計(jì)

    1、正向引物:建議根據(jù)完整miRNA序列除去3'末端6個(gè)堿基的剩余部分作為miRNA正向特異性引物,并將其中的U替換為T。也可使用本司提供的miRNA Design軟件設(shè)計(jì),軟件和說明書請(qǐng)?jiān)凇局Z唯贊-資源支持-實(shí)驗(yàn)工具】處下載。

    2、反向引物::莖環(huán)法的qPCR反向通用引物為莖環(huán)逆轉(zhuǎn)錄引物中莖環(huán)結(jié)構(gòu)序列的一部分,所用莖環(huán)序列為GTCGTATCCAGTGCAGGGTCCGAGGTATTCGCACTGGATACGAC;本產(chǎn)品提供用于qPCR檢測(cè)的反向通用引物mQ Primer R,與本公司miRNA Design 軟件設(shè)計(jì)的逆轉(zhuǎn)錄引物配套,無需另外合成;當(dāng)使用不同的莖環(huán)序列時(shí),需自行設(shè)計(jì)合成qPCR下游引物。

    加尾定量引物設(shè)計(jì)

    1.正向引物:

    建議根據(jù)完整miRNA序列設(shè)計(jì)miRNA正向特異性引物,并將其中的U替換為T。

    若根據(jù)miRNA序列設(shè)計(jì)的正向特異性引物退火溫度過低,建議在引物5'端增加幾個(gè)堿基(以GC為主),增加堿基后需驗(yàn)證引物特異性,以免造成非特異性擴(kuò)增;若引物退火溫度過高,建議刪去5'端幾個(gè)堿基。

    ③對(duì)于miRNA前體等長(zhǎng)片段非特異性擴(kuò)增,建議在正向特異性引物3'端增加1-3個(gè)A堿基。

    對(duì)于序列相似的miRNA,建議正向特異性引物3'端終止于差異堿基,若由于引物長(zhǎng)度過短而導(dǎo)致退火溫度過低,可在引物5'端增加幾個(gè)堿基,使上下游引物Tm值匹配。反向

    2.2、反向引物:本公司Vazyme MR102中提供用于qPCR檢測(cè)的反向通用引物 Universalreverse Q primer,退火溫度約為66℃,無需另外合成;當(dāng)使用不同的逆轉(zhuǎn)錄試劑時(shí),需自行設(shè)計(jì)合成qPCR逆向引物。

    ·注意事項(xiàng)

    1.本品盡量避免反復(fù)凍融,以免造成酶活下降。如每次使用量較少,推薦小份分裝使用。

    2.使用前請(qǐng)上下顛倒以混勻Master Mix,請(qǐng)勿vortex避免產(chǎn)生氣泡,影響定量結(jié)果。MasterMix經(jīng)混勻短暫離心后即可使用。

    3.由于本品中含有熒光染料SYBR Green1,因此需避光保存,配制反應(yīng)體系時(shí)應(yīng)盡量避免強(qiáng)光照射。

    4.由于本品檢測(cè)靈敏度特高,易被空氣中氣溶膠污染。因此反應(yīng)體系配制時(shí)請(qǐng)于超凈工作臺(tái)內(nèi)進(jìn)行,配制過程中請(qǐng)使用滅菌槍頭、反應(yīng)管,條件容許的實(shí)驗(yàn)室推薦使用專用的移液槍和帶濾芯的槍頭。

    5.本品中的藍(lán)色染料經(jīng)測(cè)試不影響SYBR GreenI熒光的信號(hào)采集。

    ·實(shí)驗(yàn)流程

    1.在qPCR管中配制如下混合液

    莖環(huán)法(相對(duì)定量?jī)?nèi)參體系配制參考右表)

    加尾法(相對(duì)定量?jī)?nèi)參體系配制參考右表)


    2.按下列條件進(jìn)行qPCR反應(yīng):


    miRNA逆轉(zhuǎn)錄及實(shí)時(shí)熒光定量PCR的常見FAQ
    1.miRNA逆轉(zhuǎn)錄的常見FAQ

    莖環(huán)法VazymeMR101能否用于加PolyA)尾法逆轉(zhuǎn)錄?

    不能。MR101是通過莖環(huán)法逆轉(zhuǎn)miRNA,利用莖環(huán)引物在逆轉(zhuǎn)錄酶的作用下獲得cDNA。而加PolyA)尾法體系中含有兩個(gè)酶的作用,首先是PolyA)聚合酶在單鏈RNA3'端加上一串PolyA)尾,然后利用體系中的Oligo dT通用型引物在逆轉(zhuǎn)錄酶的作用下進(jìn)行逆轉(zhuǎn)錄反應(yīng)。MR101中沒有PolyA)聚合酶,故不能用于Poly(A)尾法逆轉(zhuǎn)錄。

    為什么莖環(huán)法Vazyme #MR101帶基因組清除組分,而加尾法Vazyme #MR201不帶基因組清除組分?
    因?yàn)镸R201中的Poly(A)聚合酶(PAP)不能對(duì)基因組DNA進(jìn)行加尾,逆轉(zhuǎn)錄引物無法識(shí)別基因組DNA,所以MR201中不帶專門基因組清除的組分。


    2、實(shí)時(shí)熒光定量PCR的常見FAQ

    ·miRNA推薦使用的內(nèi)參:

    small nucleolar RNAsnoRNA)長(zhǎng)度約為60300nt左右,在多種組織細(xì)胞中高表達(dá),不涉及miRNA的調(diào)節(jié)途徑,所以snoRNA是很好的內(nèi)參選擇。研究證實(shí)常用的snoRNAassays 包括:

    Human:U6、RNU48RNU44、U47;

    Mouse:U6、snoRNA-202、snoRNA-234、snoRNA-420;

    還有一類是在不同實(shí)驗(yàn)條件下變化差異很小的miRNA

    Human/mouse tissues: miR-152、-186、-25、-92、-26b、-16;

    Human/mouse cell lines: miR-374、-16-93、-186、-26b;

    還有一類是傳統(tǒng)沿用的18S rRNA or U6。


    莖環(huán)法miRNA做逆轉(zhuǎn)、定量時(shí),內(nèi)參的逆轉(zhuǎn)錄引物和qPCR引物如何設(shè)計(jì)?以常用的U6內(nèi)參為例,U6的序列足夠長(zhǎng),因此不需要設(shè)計(jì)莖環(huán)引物(當(dāng)內(nèi)參產(chǎn)物長(zhǎng)度在80bp以上時(shí)就不需要設(shè)計(jì)莖環(huán)引物),U6在逆轉(zhuǎn)錄的時(shí)候投入qPCR下游引物即可,可以看作投入逆轉(zhuǎn)錄的特異性引物逆轉(zhuǎn),后續(xù)qPCR定量的時(shí)候正常投入上下游引物即可。


    加尾法miRNA做逆轉(zhuǎn)、定量時(shí),內(nèi)參的逆轉(zhuǎn)錄引物和qPCR引物如何設(shè)計(jì)?加尾法逆轉(zhuǎn)錄可以對(duì)提取純化的所有mRNAmiRNA進(jìn)行無差別加尾,因此不需要對(duì)內(nèi)參做單獨(dú)處理。


    擴(kuò)增曲線形狀異常?

    1.?dāng)U增曲線不光滑:信號(hào)太弱,經(jīng)系統(tǒng)矯正后產(chǎn)生,提高模板濃度重復(fù)實(shí)驗(yàn)。

    2.?dāng)U增曲線斷裂或下滑:模板濃度較高,基線的終點(diǎn)值大于C4值。減小基線終點(diǎn)(C1-4),重新分析數(shù)據(jù)。

    3.個(gè)別擴(kuò)增曲線突然驟降:反應(yīng)管內(nèi)留有氣泡,處理樣本時(shí)要注意離心,進(jìn)行擴(kuò)增反應(yīng)之前要仔細(xì)檢查反應(yīng)管內(nèi)是否有氣泡殘留。

    反應(yīng)結(jié)束無擴(kuò)增曲線出現(xiàn)?

    1.反應(yīng)循環(huán)數(shù)不夠:一般設(shè)置循環(huán)數(shù)為40,但需要注意的是過多的循環(huán)會(huì)增加過多的背景信號(hào),降低數(shù)據(jù)可信度。

    2.確認(rèn)程序中是否設(shè)置了信號(hào)采集步驟:兩步法擴(kuò)增程序一般將信號(hào)采集設(shè)置在退火延伸階段;三步法擴(kuò)增程序應(yīng)當(dāng)將信號(hào)采集設(shè)置在72℃延伸階段。

    3.確認(rèn)引物是否降解:長(zhǎng)時(shí)間未用的引物應(yīng)先通過PAGE電泳檢測(cè)完整性,以排除其降解的可能。

    4.模板濃度太低:減少稀釋度重復(fù)實(shí)驗(yàn),一般未知濃度的樣品先從最高濃度做起。

    5.模板降解:重新制備模板,重復(fù)實(shí)驗(yàn)。


    Cr值出現(xiàn)太晚?

    1.?dāng)U增效率極低:優(yōu)化反應(yīng)條件,嘗試三步法擴(kuò)增程序,或者重新設(shè)計(jì)合成引物。

    2.模板濃度太低:減少稀釋度重復(fù)實(shí)驗(yàn),一般未知濃度的樣品先從最高濃度做起。

    3.模板降解:重新制備模板,重復(fù)實(shí)驗(yàn)。

    4.體系中存在PCR抑制劑:一般為模板帶入,加大模板稀釋倍數(shù)或者重新制備模板重復(fù)實(shí)驗(yàn)。


    溶解曲線出現(xiàn)多峰?

    1.引物設(shè)計(jì)不優(yōu):根據(jù)設(shè)計(jì)原則設(shè)計(jì)合成新的引物;莖環(huán)法可嘗試引物設(shè)計(jì)時(shí)向前延伸幾個(gè)堿基,增加引物特異性。

    2.引物濃度太高:適當(dāng)降低引物濃度。

    3cDNA模板帶有基因組污染:重新制備cDNA模板。


    ·陰性對(duì)照出現(xiàn)明顯擴(kuò)增?

    1.反應(yīng)體系污染:更換新的MixddH2O、引物重復(fù)實(shí)驗(yàn)。反應(yīng)體系在超凈工作臺(tái)內(nèi)配制,減少氣溶膠污染。

    2.引物二聚體的出現(xiàn):配合熔解曲線進(jìn)行分析。


    實(shí)驗(yàn)重復(fù)性差?

    1.加樣體積失準(zhǔn):配制反應(yīng)體系時(shí)盡量使用大體積移液配制,同時(shí)使用性能較好的移液槍和低吸附耗材。

    2.定量PCR儀不同位置溫度控制不一致:定期校準(zhǔn)儀器。

    3.模板濃度太低:模板濃度越低,重復(fù)性越差,減少模板稀釋度或提高加樣體積。

    ·絕對(duì)定量時(shí)標(biāo)準(zhǔn)曲線線性關(guān)系不佳?

    1.稀釋誤差:采用逐級(jí)稀釋法進(jìn)行模板稀釋,配制反應(yīng)體系時(shí)盡量使用大體積移液配制,同時(shí)使用性能較好的移液槍和低吸附耗。
    2.系計(jì)算。

    3.引物擴(kuò)增效率差:根據(jù)設(shè)計(jì)原則設(shè)計(jì)合成新的引物。

    4.標(biāo)準(zhǔn)品降解:重新制備標(biāo)準(zhǔn)品,重復(fù)實(shí)驗(yàn)。


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